Bio IT Open Roles

Chef de Projet R&D Bioinformatique (H/F)

Description

PathoQuest est une société de biotechnologie, spin off de l’institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le diagnostic des maladies infectieuses et la sécurisation des produits pharmaceutiques d’origine biologique. Notre business unit « Biologics Genomic Service » propose aux acteurs de l’industrie pharmaceutique un service expert en génomique, basé sur une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et sur des pipelines d’analyses bioinformatiques de pointe. Les débits délivrés par les technologies NGS nous confrontent régulièrement à des problématiques type « Big Data » et de plus en plus d’acteurs de premier plan de l’Industrie des Biotechnologies et de la Pharma nous font confiance pour évaluer la sécurité virale et la stabilité génétique de leur produits biologiques innovants. Aujourd’hui en pleine expansion, nous renforçons notre pôle Recherche & Développement – Analyses Bioinformatiques – Caractérisation Génétique.

Vos Missions

Sous la responsabilité directe du Directeur du Département de Bioinformatique, votre savoir-faire vous permet de soutenir notre croissance et ouvrir de nouveaux marchés. Votre mission sera la conduite de projets R&D bioinformatique en lien notamment avec notre activité caractérisation génétique de produits (vecteurs) ou de systèmes de production cellulaires (banques cellulaires).

Vos responsabilités

  • Participer aux activités de Recherche et Développements autour des pipelines d’analyses de la société : fouille des données, veille scientifique, benchmarks d’outils et de process, développements dédiés
  • Évaluer / challenger la performance du pipeline de caractérisation génétique et mener à bien son développement, sa validation pour une opération en environnement BPL/BPF (Bonnes Pratiques de Laboratoire/Fabrication), son maintien et son optimisation (banques, workflow d’analyses, documentation, benchmarks)
  • Analyser les données de séquençage et les rapports fournis par les pipelines de la société, faire remonter les principaux résultats et points d’amélioration
  • Tester et comparer de nouveaux outils de la communauté en vue de l’optimisation des pipelines d’analyses de la société
  • Participer à l’assurance qualité des produits selon le référentiel des Bonnes Pratiques de Laboratoire/Fabrication (BPL/BPF)

Description du profil

  • L’innovation vous passionne, le défi vous motive
  • Forte attirance pour le travail en équipe
  • Master 2 Bioinformatique avec 3 ans d’expérience minimum ou d’un doctorat en Bioinformatique
  • Scripting/Programmation (Shell, R, python)
  • Expérience dans l’analyse de données NGS
  • Bonne connaissance des algorithmes et outils de détection de variants génétiques (SNPs, SNVs…)
  • Une connaissance des algorithmes et outils d’assemblage de génomes/transcriptomes est un plus
  • Niveau basique en statistiques (statistiques descriptives, tests d’hypothèses)
  • Anglais courant (oral, écrit)

Ce poste est basé à Paris 13, le contrat est à durée indéterminée.

Si vous avez envie de travailler au sein d’une start-up dynamique, innovante et avec de grandes ambitions ; envoyez-nous votre candidature (CV et lettre de motivation) à recrutement@pathoquest.com

Service Client – Expert Bioinformatique Sénior (H/F)

Description

PathoQuest est une société de biotechnologie, spin off de l’institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le diagnostic des maladies infectieuses et la sécurisation des produits pharmaceutiques d’origine biologique. Notre business unit « Biologics Genomic Service » propose aux acteurs de l’industrie pharmaceutique un service expert en génomique, basé sur une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et sur des pipelines d’analyses bioinformatiques de pointe. Les débits délivrés par les technologies NGS nous confrontent régulièrement à des problématiques type « Big Data » et de plus en plus d’acteurs de premier plan de l’Industrie des Biotechnologies et de la Pharma nous font confiance pour évaluer la sécurité virale et la stabilité génétique de leur produits biologiques innovants. Aujourd’hui en pleine expansion, nous renforçons notre Service Client – Expert Bioinformatique Sénior.

Missions

Sous la responsabilité directe du Directeur du Département de Bioinformatique, votre savoir-faire vous permet de soutenir notre croissance et d’accroître notre notoriété à l’international. Votre principale mission sera d’assurer le lien scientifique et bioinformatique entre nos équipes de développement et opérationnelles qui réalisent les analyses clients. Au contact de nos clients (externes et internes), vous formaliserez notamment les retours et demandes d’améliorations qui viendront nourrir les développements innovants de notre société.

Vos responsabilités 

  • Manager scientifiquement nos équipes bioinformatiques opérationnelles française et américaine impliquées dans les analyses clients
  • En interaction avec nos clients, prendre part au processus d’amélioration continue de nos processus impactant les diverses offres commerciales de notre société
  • En interaction avec les chefs de projets R&D bioinformatique, définir les spécifications des améliorations des services déjà commercialisés et des potentielles nouvelles offres
  • Assurer une veille scientifique, benchmarks d’outils et de process, développements dédiés
  • Participer à l’assurance qualité des produits selon le référentiel des Bonnes Pratiques de Laboratoire/Fabrication (BPL/BPF)

Description du profil

  • L’innovation vous passionne, le défi vous motive
  • Forte attirance pour le travail en équipe
  • Doctorat en Bioinformatique ou Biologie Computationnelle avec 8 ans d’expérience minimum
  • Scripting/Programmation (Shell, R, python)
  • Expérience dans l’analyse de données NGS
  • Bonne connaissance des approches et algorithmes usuels en bioinformatique
  • Statistiques descriptives, avancées et tests d’hypothèses
  • Référent métier également pour notre filiale américaine, d’excellentes compétences en communication en anglais sont requises. Une expérience aux Etats-Unis est un plus.

Ce poste est basé à Paris 13, le contrat est à durée indéterminée.

Si vous avez envie de travailler au sein d’une start-up dynamique, innovante et avec de grandes ambitions ; envoyez-nous votre candidature (CV et lettre de motivation) à recrutement@pathoquest.com

Let’s Work Together

If you are interested in what we do and believe you have the appropriate experience and  expertise to join the PathoQuest team, please send your resume and cover letter to office@pathoquest.com