Bio IT Open Roles

Ingénieur R&D Bio-informatique (H/F)

– Paris | FRANCE –

Description

PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production des certificats d’analyse. Ses tests reposent sur des protocoles propriétaires de traitement des échantillons, une plateforme de séquençage haut débit et des pipelines d’analyses bioinformatiques spécialisés. Actuellement en phase de scale-up, nous comptons une cinquantaine de collaborateurs en France et aux Etats-Unis.

Nous recherchons actuellement au sein de notre pôle Recherche et Développement – Analyses Bioinformatiques – Sécurité Virale un(e) Ingénieur(e) R&D Bioinformatique.

Missions :

Dans le cadre de la stratégie de l’entreprise, sous la responsabilité directe du Chief Technology and Information Officer et en collaboration avec le Chef de Projet Bio-informatique, vous assurez le développement et l’optimisation d’outils (bio)informatiques pour l’identification d’agents pathogènes au sein d’échantillons biologiques.

Vos activités : 

  • Réaliser les analyses bio-informatiques des données produites par les plates-formes de séquençage, notamment celles qui concernent les prestations de sécurité virale (activité Biologics Genomic Service BGS)
  • Collaborer avec l’équipe informatique pour le développement de modules fonctionnels utilisés par l‘ensemble des briques logicielles des pipelines de sécurité virale tenant compte des référentiels normatifs et réglementaires en vigueur
  • Suivre la démarche qualité de l’entreprise lors des phases de conception, de développement et de déploiement des produits logiciels bioinformatiques, notamment en rédigeant les documents associés (spécifications fonctionnelles, cahier de tests)
  • Développer et animer les activités de recherche et de développement de l’entreprise, permettant notamment de consolider les produits logiciels existants et d’apporter de nouvelles applications pour l’analyse des données de séquençage
  • Assurer la veille technologique en (bio)informatique
  • Permettre et automatiser la génération de compte rendus liés à l’activité BGS en tenant compte des référentiels normatifs et réglementaires en vigueur

 Profil recherché :

  • L’innovation vous passionne, le défi et le challenge vous motivent
  • Forte attirance pour le travail en équipe

 Vous êtes diplômé(e) d’un Master en (bio)informatique

Vous avez une expérience professionnelle confirmée dans l’analyse de données NGS. 

  • Scripting/Programmation (Shell, R, python)
  • Une connaissance des algorithmes et outils d’assemblage de génomes/transcriptomes serait un plus
  • Niveau basique en statistiques (statistiques descriptives, tests d’hypothèses)
  • Notions en assurance qualité
  • Anglais courant (oral, écrit)

Ce poste est basé à Paris 13 (proche Bibliothèque François Mitterrand), le contrat est à durée indéterminée.

Si vous avez envie de travailler au sein d’une start-up dynamique, innovante et avec de belles ambitions : envoyez-nous votre CV à recrutement@pathoquest.com

 

Let’s Work Together

If you are interested in what we do and believe you have the appropriate experience and  expertise to join the PathoQuest team, please send your resume and cover letter to office@pathoquest.com

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